原料酶選擇之困:酶的異質(zhì)性解析
酶的異質(zhì)性及其表現(xiàn)
與化學(xué)品不同,不同廠家生產(chǎn)的相同名稱的酶,在活力、性能和應(yīng)用場(chǎng)景上往往有顯著差異,我們稱之為酶的異質(zhì)性。主要表現(xiàn)為以下4個(gè)方面:
1、名不符實(shí)。也就是同一個(gè)名稱下其實(shí)是不同的蛋白。典型例子就是限制酶的同裂酶,同裂酶的反應(yīng)條件、底物偏好往往存在差異,不能簡(jiǎn)單替換。
?不同廠家的限制酶同裂酶效果對(duì)比(引自國(guó)外某公司網(wǎng)站)
2、改造策略不同。比如最常用的Taq酶,各家都有自己的突變體,雖然效果優(yōu)于野生型,但也帶來(lái)了緩沖液和抗體不通用等諸多問(wèn)題(詳見(jiàn) 你購(gòu)買的Taq酶抗體好用么?)。
3、酶活定義不同。比如幾家主要廠商T4連接酶的活性定義存在上百倍的差異,導(dǎo)致用戶選擇時(shí)產(chǎn)生困惑(詳見(jiàn) 探秘T4連接酶:基因“分子縫合針”)。
4、生產(chǎn)工藝不同。例如,不同的純化標(biāo)簽可能帶來(lái)活性或穩(wěn)定性的變化;大腸桿菌表達(dá)的Taq酶就不適用于檢測(cè)腸道微生物;疫苗生產(chǎn)使用的酶不能用肝素純化等等。
愚公生物怎么做
酶的異質(zhì)性及其帶來(lái)的種種問(wèn)題,是用戶選擇酶、使用酶的最大痛點(diǎn)。面對(duì)異質(zhì)性帶來(lái)的種種問(wèn)題,愚公生物怎么做呢?
對(duì)于酶活定義差異較大的酶,比如T4連接酶等,會(huì)提供換算表格,方便用戶比較。
2. 應(yīng)用多元化,廠家的體系不能互換怎么辦?那就將更多數(shù)據(jù)呈現(xiàn)給客戶,減少客戶的麻煩。比如我們把愚公生物限制酶在不同廠商緩沖液中的活性,制成詳細(xì)表格,方便用戶使用不同品牌的限制酶實(shí)現(xiàn)雙酶切。
對(duì)于Taq DNA聚合酶抗體,我們建立了一個(gè)Taq酶抗體庫(kù),篩選了對(duì)常見(jiàn)突變體活性的封閉效果,方便客戶去適配抗體(詳見(jiàn) 你購(gòu)買的Taq酶抗體好用么?)
3. 堅(jiān)持只做高純度、低雜質(zhì)酶。優(yōu)化生產(chǎn)工藝,完善質(zhì)量控制,提高單次產(chǎn)量,減少批次差異,保證從愚公生物出廠的產(chǎn)品前后一致。